瑕疵豆是破坏最后咖啡风味的重要因素。所以在生豆处理的最后一步也要将瑕疵豆去除。所以按瑕疵豆比例，辅以筛网大小也作为一种分级方式。 由于精品咖啡风潮的兴起，咖啡生产国越来越注重咖啡的品质，控制瑕疵豆是最重要的一个途径，所以基本上采用瑕疵豆比例的方式作为分级方式或者辅助的依据越来越普遍

目前采用瑕疵豆比例法的主要的代表国家有牙买加，巴西，埃塞俄比亚等。牙买加是以产区，海拔，筛网，瑕疵豆比例综合作为评级标准，瑕疵豆比例作为重要的依据。牙买加严格控制瑕疵豆的比例，各个等级中瑕疵豆的比例最大不过4%。

巴西是另外一个比较特殊的国家。巴西是世界上最大的咖啡产国，由于产量大，产地多，分级的工作相当麻烦，也不适合采用单一的分级标准，所以巴西也是同时采用多种分级方式，瑕疵豆比例、筛网、杯评测试都运用在巴西咖啡豆分级过程中。前两种不必多言，杯评测试则是巴西咖啡分级的特点之一。

所谓杯评测试就是咖啡生豆经过烘焙后研磨成粉用热水（90度左右）浸泡对其进行香气味道等方面的评价。主要分为6个等级：Strictly Soft极温和，Soft温和，Softish稍温和，Hard艰涩，Rio淡碘味，Rioy浓烈碘味。前三个等级可以统一称为温和，咖啡的酸甜均衡，口感温和。后三种则是口感稍差一些，尤以后两种最差，之所以会出现碘味，是因为里约热内卢附近的土壤带有浓烈碘味，咖啡采收时掉落在地上沾染吸附土壤异味所致

以上三种是现在比较流行的咖啡分级方式，但并不是全部。如埃塞俄比亚会把咖啡生豆的处理方式也作为分级的标准之一。除此之外还有越来越被广泛采用的COE评级制度，随着咖啡生产国对咖啡品质越来越重视和生产者积极性的提高，咖啡生豆的分级方式也不局限于上述三种主要的方式了。只有更精心的种植才能生产出更高品质的咖啡，才能在等级评定中获得高的评价，所以咖啡评级的细分和严格控这对于咖啡品质的提升无疑是件好事。